O que saber
- Alguns arquivos PDB são arquivos de banco de dados de programas.
- Abra um com um editor de texto ou um programa como o Geneious.
- Converta para outro formato com o mesmo programa que abre seu arquivo de banco de dados específico.
Este artigo explica o que é um arquivo PDB, como abri-lo e como convertê-lo para um formato diferente.
Definição de um arquivo PDB
Um arquivo com o PDB extensão de arquivo é provavelmente um arquivo de banco de dados de programa usado para armazenar informações de depuração sobre um programa ou módulo, como um DLL ou EXE arquivo. Às vezes são chamados de arquivos de símbolos.
O arquivo mapeia vários componentes e instruções no código-fonte para seu produto final compilado, que o depurador pode usar para localizar o arquivo de origem e o local no executável no qual deve interromper o processo de depuração.
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Alguns arquivos PDB podem estar no formato de arquivo Protein Data Bank. Estes são simples arquivos de texto que armazenam coordenadas relativas às estruturas das proteínas.
Outros arquivos PDB podem ser criados no formato de arquivo Palm Database ou PalmDOC e usados com o PalmOS mobile sistema operacional ; alguns arquivos neste formato usam a extensão de arquivo .PRC. Outro formato que usa a mesma extensão é o Tanida Demo Builder.
Como abrir um arquivo PDB
Diferentes programas usam seu próprio arquivo PDB para armazenar dados em algum tipo de formato de banco de dados estruturado, de modo que cada aplicativo é usado para abrir seu próprio tipo.
Generoso , Acelerar , Estúdio visual , e Pégaso são apenas alguns exemplos de programas que podem usar o arquivo como um arquivo de banco de dados. radares e PDBparse também pode funcionar.
Alguns arquivos PDB são armazenados como texto simples, como os arquivos Program Debug Database do Geneious, e são completamente legíveis por humanos se abertos em um editor de texto . Você pode abrir esse tipo de arquivo PDB com qualquer programa que possa ler documentos de texto, como o programa Bloco de Notas integrado no Windows. Alguns outros visualizadores e editores compatíveis incluem Bloco de notas++ e Colchetes .
Outros arquivos PDB não são documentos de texto e só são úteis quando abertos com o programa ao qual se destinam. Por exemplo, se o seu estiver relacionado de alguma forma ao Quicken, tente usar esse software para visualizá-lo ou editá-lo. O Visual Studio espera ver um arquivo PDB na mesma pasta que o arquivo DLL ou EXE.
Você pode visualizar e editar arquivos do Protein Data Bank no Windows, Linux e macOS com Avogrado . Estes programas também podem abrir o arquivo: Jmol , Ras Mol , QuickPDB , e Quimera USCF . Como se trata de texto simples, você também pode abrir um em um editor de texto.
Palm Desktop deverá ser capaz de abrir esse arquivo se ele estiver no formato de arquivo Palm Database, mas talvez seja necessário primeiro renomeá-lo para que a extensão de arquivo PRC seja reconhecida pelo programa. Calibre é outra opção.
Para abrir um arquivo PalmDOC PDB, tente Visualizador STDU .
Construtor de demonstração Tanida abre arquivos nesse formato.
Como converter um arquivo PDB
Os arquivos de banco de dados do programa provavelmente não podem ser convertidos para um formato de arquivo diferente, pelo menos não com um ferramenta normal de conversão de arquivos . Em vez disso, se houver algum aplicativo que possa converter esse tipo de arquivo, será o mesmo programa que poderá abri-lo.
Por exemplo, se você precisar converter seu arquivo de banco de dados do Quicken, tente usar esse programa para fazer isso. Este tipo de conversão, no entanto, provavelmente não é apenas de pouca utilidade, mas também não é suportado nestas aplicações de banco de dados (ou seja, você provavelmente não precisa converter este tipo de arquivo PDB para qualquer outro formato).
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Os arquivos do Protein Data Bank podem ser convertidos para outros formatos com Laboratório de malha . Para fazer isso, talvez seja necessário primeiro convertê-lo para WRL com PyMOL de Arquivo > Salvar imagem como > VRML menu e, em seguida, importe o arquivo WRL para o MeshLab e use o Arquivo > Exportar malha como menu para finalmente converter o arquivo PDB para STL ou outro formato de arquivo.
Se você não precisa que o modelo seja colorido, você pode exportar o arquivo diretamente para STL com USCF Chimera (o link para download está acima). Caso contrário, você pode usar o mesmo método acima (com MeshLab) para converter PDB em WRL com USCF Chimera e depois exportar WRL para STL com MeshLab.
Para converter PDB em PDF ou EPUB , se você tiver um arquivo PalmDOC, é possível de várias maneiras, mas a mais fácil provavelmente é usar um conversor online como o Zamzar. Você pode enviar seu arquivo para esse site para ter a opção de convertê-lo para esses formatos, bem como para AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT e outros formatos de arquivo de e-book.
Para converter um para o formato FASTA pode ser feito com Conversor online de PDB para FASTA da Meiler Lab .
Também é possível salvar este arquivo em CIF (formato de informação cristalográfica) online usando PDBx/mmCIF .
Ainda não consegue abri-lo?
Arquivos que não abrem com nenhuma das ferramentas acima provavelmente não são arquivos PDB. O que pode estar acontecendo é que você está interpretando mal a extensão do arquivo; alguns formatos usam um sufixo que se assemelha muito ao PDB, quando na verdade não estão relacionados e não funcionam da mesma forma.
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Por exemplo, um arquivo PDF é um arquivo de documento, mas a maioria dos programas acima não renderizará o texto e/ou imagens corretamente se você tentar abrir um com esses programas de software. O mesmo se aplica a outros arquivos com extensões de arquivo com grafia semelhante, como DBF , BD , ADP, PD, PDE, PDC, DOP e WPD arquivos.
PBD é outro que pertence ao programa EaseUS Todo Backup e, portanto, só é útil quando aberto com esse software.
Se você não tiver um arquivo PDB, pesquise a extensão do arquivo para encontrar o programa apropriado que o abre ou converte.
Leitura avançada em arquivos PDB
Você pode ler muito mais sobre arquivos de banco de dados de programas em GitHub e Wintellect .
Também há mais para aprender sobre os arquivos do Protein Data Bank; ver Banco Mundial de Dados de Proteínas e APO RCSB .
Perguntas frequentes- Como posso corrigir isso quando o Visual Studio não consegue encontrar ou abrir arquivos PDB?
Se você vir uma mensagem informando que o Visual Studio não consegue localizar ou abrir o arquivo PDB, tente usar a ferramenta de depuração do Visual Studio. Vá para Ferramentas > Opções > Depuração > Símbolos e selecione Servidores de Símbolos Microsoft.
- Como abro um arquivo PDB no Android?
Use um leitor de arquivos de terceiros. Baixe o aplicativo Cool Reader ou qualquer outro leitor compatível com arquivo PDB no Google Play.